はい、［年末調整］－［電子申告データ作成］－［給与支払報告書ファイル］から給与支払報告書のデータを作成し、eLTAXソフト（Pcdesk）に読み込めます。
ただし、eLTAXはさまざまな税目の申告データ作成や税金の納付ができますが、給与システムで対応しているのは「給与支払報告書」のみです。

※修正データを作成する場合は、「☑ 訂正再提出用」にチェックしてデータを作成してください。