備考欄の「年調精算額と計算額不一致」は、年調データを作成してから精算がおこなわれるまでの間と、
精算後に年末調整の計算に関わるデータを変更した場合に表示されるものです。
精算をおこなえばこのメッセージは表示されなくなります。

精算後にこのメッセージが表示されている場合は、年調データの内容に相違がないか確認し、年調データを
修正するか、精算処理をやり直してください。