賞与引当金・退職給与引当金に関する科目は非資金科目として登録されるため、資金収支計算書と事業活動収支計算書の人件費に差額が生じることがあります。

差額が以下の関係になっているかご確認ください。

事業活動の人件費－資金収支の人件費
＝賞与引当金繰入額＋退職給与引当金繰入額－賞与引当金特別繰入額

上記の関係になっている場合は、引当金に関する非資金科目が事業活動収支には計上される一方、資金収支には反映されないことによる差額ですので、問題ありません。