前年度で決算確定後に、最終的な金額で年度繰越処理（再繰越）を行っていない可能性があります。

再度［年度繰越処理］を行い、残高が一致するかご確認ください。
参考FAQ：決算確定後の年度繰越方法

繰越処理後も残高が一致しない場合は弊社システムサポート部までお問合せください。
個別に原因を調査いたします。