はい、できます。以下の手順で操作してください。

①［年末調整］メニューから［給与所得の源泉徴収票］を選択します。
②「印刷様式」タブに移動し、「出力範囲」の「□ 支給額○○万円を越える職員のみ印刷」にチェックし、＜▼＞ボタンをクリックして金額を「250」に指定します。
③「年末調整提出区分」は「□ A,B以外の職員」のみチェックします。
④＜プレビュー＞ボタンをクリックして出力内容を確認し、問題がなければ＜印刷＞ボタンをクリックして出力してください。

※「年末調整一覧表」「法定調書内訳表」の印刷設定にも、「□ 支給額250万円を越える職員のみ印刷」の出力条件があります。